Diabetes Mellitus adalah salah satu penyakit metabolik yang disebabkan oleh gangguan regulasi glukosa, dan interaksi antar protein memiliki peran penting dalam perkembangan penyakit ini. Penelitian ini bertujuan untuk mengimplementasikan algoritma ClusterONE. Algoritma ClusterONE termasuk dalam jenis algoritma graph clustering sehingga diperoleh hasil cluster-cluster pada interaksi protein-protein yang digambarkan dalam visualisasi graf. Protein signifikan diperoleh dari nilai overall centrality. Pada penelitian ini protein signifikan, yaitu protein IL6 sebesar 0.242717. Algoritma ClusterONE berhasil mengidentifikasi 8 cluster yang memiliki keterkaitan dengan penyakit Diabetes Mellitus. Selanjutnya, dilihat overlapping cluster yang menunjukkan protein IL6 berada lebih dari 1 cluster (8 clusters). Berdasarkan nilai Cohesiveness, diperoleh Cluster 3 yang memiliki nilai tertinggi sebesar 0.8623, dan nilai P-value yang terendah, yaitu sebesar 0.00 (< 0.05). Hal ini menunjukkan Cluster 3 sebagai cluster yang paling signifikan dan berperan sebagai biomarker penyakit Diabetes Mellitus.
Kata kunci; ClusterONE;Diabetes Mellitus;Interaksi Protein-Protein;Centrality