Keberadaan bakteri indigenous Stenotrophomonas maltophilia LA3B belum dimanfaatkan secara optimal. Salah satu upaya pemanfaatannya adalah dijadikan sebagai agen pupuk hayati. Limbah padat hasil industri pengolahan agar-agar (LIA) dan tepung ikan potensial dijadikan sebagai bahan pembawa pupuk hayati. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi S. maltophilia LA3B sebagai agen pupuk hayati serta menemukan formulasi terbaik hasil kombinasi antara konsentrasi LIA, tepung ikan, dan waktu inkubasi terhadap pertumbuhan sel, aktivitas enzim selulase dan produksi hormon IAA. Penelitian ini meliputi karakterisasi S. maltophilia LA3B sebagai kelompok Plant Growth Promoting Bacteria (PGPB) pada media selektif serta pengukuran pertumbuhan sel, aktivitas enzim selulase, dan produksi hormon IAA pada media perlakuan dengan variasi konsentrasi LIA (1%,2%,3%), tepung ikan (0,1%,0,2%,0,3%), dan waktu inkubasi (hari ke-1,3,5,7,9,11). Hasil karakterisasi S. maltophilia LA3B sebagai kelompok PGPB menunjukkan kemampuan bakteri sebagai pelarut fosfat, kalium, kitinolitik, dan penghasil hormon IAA. Hasil analisis variansi (ANOVA) menunjukkan interaksi dari kombinasi ketiga faktor perlakuan (konsentrasi LIA, tepung ikan, dan waktu inkubasi) berpengaruh nyata terhadap pertumbuhan sel, aktivitas enzim selulase, dan produksi hormon IAA (sig.