Kemangi (Ocimum basilicum) merupakan salah satu tanaman fungsional yang popular di masyarakat Jawa Barat dan Banten. Tanaman tersebut memiliki potensi sebagai antioksidan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa aktif antioksidan dan menentukan senyawa penciri (biomarker) dari tanaman kemangi asal Jawa Barat dan Banten melalui pendekatan metabolomik. Sampel diperoleh dari tujuh pohon yang berbeda pada suatu lahan di daerah Kabupaten Bogor (Jawa Barat) dan Kabupaten Pandeglang (Banten). Kemangi diekstraksi dengan teknik maserasi menggunakan pelarut metanol selama 24 jam, diukur aktivitas antioksidan dengan metode 2,2-difenil-1-pikrilhidrazil (DPPH). Analisis kandungan metabolit sekunder menggunakan liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) dan penentuan senyawa penciri (biomarker) menggunakan aplikasi Unscramble X melalui analisis PCA. Hasil Penelitian menunjukkan bahwa kemangi memiliki 24 senyawa metabolit sekunder yang terdiri dari golongan terpenoid, fenolik hidrokuinon, flavonoid, dan fenil propanoid. Sampel asal Kabupaten Pandeglang (Pandeglang 7) memiliki nilai aktivitas antioksidan tertinggi dengan IC50 sebesar 43,35 ppm. Berdasarkan hasil analisis PCA, senyawa penciri kemangi Pandeglang adalah nevadensin dan kemangi Bogor adalah salvigenin. Aktivitas antioksidan dari tanaman ini kemungkinan dipengaruhi oleh senyawa pencirinya.
Kata kunci : Antioksidan, kemangi, metabolomik, pangan fungsional