Karakteristik morfologi merupakan metode pengukuran untuk mengetahui jenis ikan tertentu berdasarkan perbedaan dan kemiripan badan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui secara spesifik perbedaan karakter morfologi antara Arwana kalimantan dengan Arwana irian yang memiliki morfologi sangat mirip, serta pola pertumbuhannya. Analisis data menggunakan pendekatan kuantitatif diskriminan dengan regresi linear. Pengukuran meristik dianalisis secara deskriptif, sedangkan hubungan panjang dengan berat menggunakan persamaan Linear Allometrik Model (LAM). Perbedaan Arwana kalimantan dan Arwana irian meliputi panjang sirip ventral, panjang sungut, tinggi sirip anal, panjang sebelum sirip dorsal, panjang tubuh awal sirip anal hingga awal sirip dorsal, tinggi sirip caudal, dan panjang tubuh awal sisik punggung hingga awal sirip anal. Pertumbuhan bobot pada Arwana kalimantan lebih cepat dibandingkan dengan pertumbuhan panjang tubuhnya (Allometrik positif), sedangkan untuk Arwana irian sebaliknya (Allometrik negatif). Perbedaan Strain pada Arwana kalimantan merupakan sinonim atas satu spesies Scleropages formosus.
Kata Kunci : Allometrik, Arwana irian, Arwana kalimantan, Meristik, Morfometr