Image of Virtual screening senyawa antioksidan ekstrak etanol biji gandaria (bouea macrophylla) melalui pendekatan molecular docking

Text

Virtual screening senyawa antioksidan ekstrak etanol biji gandaria (bouea macrophylla) melalui pendekatan molecular docking



Biji gandaria (Bouea macrophylla) banyak mengandung senyawa metabolit sekunder yang salah satunya manfaatnya adalah sebagai antioksidan. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi senyawa aktif antioksidan pada biji gandaria (B. macrophylla) melalui pendekatan in silico. Ekstrak biji B. macrophylla ditentukan kandungan senyawa mengunakan instrument LCMS/MS. Senyawa yang diperoleh dari hasil analisis LCMS/MS selanjutnya dilakukan simulasi molecular docking dengan reseptor sitokrom P450 (CP450) (PDB ID:1R9O), NADPH oxidase (NO) (PBD ID:2CDU) dan xantin oxidase (XO) (PDB ID:3NRZ). Preparasi reseptor menggunakan Molegro Molecular Viewer 2.5, validasi metode menggunakan AutoDockTools 1.5.6, preparasi ligan mengunakan Marvin Sketch dan screening Lipinsky, penambatan ligan terhadap reseptor menggunakan AutoDockTools 1.5.6, visualisasi hasil docking menggunakan BIOVIA Discovery Studio Visualizer. Hasil identifikasi LCMS/MS menduga 2 senyawa diantaranya larisitrin dan asam-3,4- dihidroksimandelat. Hasil visualisasi menunjukkan mekanisme intermolekuer ligan dengan reseptor di stabilkan oleh adanya ikatan hydrogen dan interaksi hidrofobik pada residu asam amino yang terdapat pada sisi aktif seperti ikatan hydrogen pada Asn204 pada reseptor sitokrom, ikatan Val214 pada reseptor NADPH dan ikatan Arg880 pada reseptor xantin oksidase.

Kata Kunci: Bouea macrophylla, in silico, penambatan molekuler


Ketersediaan

#
Perpustakaan FST (Skripsi) KIM 338 2024
KIM338
Tersedia

Informasi Detail

Judul Seri
-
No. Panggil
KIM 338 2024
Penerbit Prodi Kimia Sains Teknologi UIN JKT : Jakarta, Ciputat.,
Deskripsi Fisik
xiv, 94 hlm: 28 cm.
Bahasa
Bahasa Indonesia
ISBN/ISSN
-
Klasifikasi
338
Tipe Isi
-
Tipe Media
-
Tipe Pembawa
-
Edisi
-
Subjek
-
Info Detail Spesifik
-
Pernyataan Tanggungjawab

Versi lain/terkait

Tidak tersedia versi lain




Informasi


Akses Katalog Publik Daring - Gunakan fasilitas pencarian untuk mempercepat penemuan data katalog