Detail Cantuman
Pencarian SpesifikText
Virtual screening senyawa antioksidan ekstrak etanol biji gandaria (bouea macrophylla) melalui pendekatan molecular docking
Biji gandaria (Bouea macrophylla) banyak mengandung senyawa metabolit sekunder yang salah satunya manfaatnya adalah sebagai antioksidan. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi senyawa aktif antioksidan pada biji gandaria (B. macrophylla) melalui pendekatan in silico. Ekstrak biji B. macrophylla ditentukan kandungan senyawa mengunakan instrument LCMS/MS. Senyawa yang diperoleh dari hasil analisis LCMS/MS selanjutnya dilakukan simulasi molecular docking dengan reseptor sitokrom P450 (CP450) (PDB ID:1R9O), NADPH oxidase (NO) (PBD ID:2CDU) dan xantin oxidase (XO) (PDB ID:3NRZ). Preparasi reseptor menggunakan Molegro Molecular Viewer 2.5, validasi metode menggunakan AutoDockTools 1.5.6, preparasi ligan mengunakan Marvin Sketch dan screening Lipinsky, penambatan ligan terhadap reseptor menggunakan AutoDockTools 1.5.6, visualisasi hasil docking menggunakan BIOVIA Discovery Studio Visualizer. Hasil identifikasi LCMS/MS menduga 2 senyawa diantaranya larisitrin dan asam-3,4- dihidroksimandelat. Hasil visualisasi menunjukkan mekanisme intermolekuer ligan dengan reseptor di stabilkan oleh adanya ikatan hydrogen dan interaksi hidrofobik pada residu asam amino yang terdapat pada sisi aktif seperti ikatan hydrogen pada Asn204 pada reseptor sitokrom, ikatan Val214 pada reseptor NADPH dan ikatan Arg880 pada reseptor xantin oksidase.
Kata Kunci: Bouea macrophylla, in silico, penambatan molekuler
Ketersediaan
Informasi Detail
Judul Seri |
-
|
---|---|
No. Panggil |
KIM 338 2024
|
Penerbit | Prodi Kimia Sains Teknologi UIN JKT : Jakarta, Ciputat., 2024 |
Deskripsi Fisik |
xiv, 94 hlm: 28 cm.
|
Bahasa |
Bahasa Indonesia
|
ISBN/ISSN |
-
|
Klasifikasi |
338
|
Tipe Isi |
-
|
Tipe Media |
-
|
---|---|
Tipe Pembawa |
-
|
Edisi |
-
|
Subjek |
-
|
Info Detail Spesifik |
-
|
Pernyataan Tanggungjawab |
Hendrawati
|
Versi lain/terkait
Tidak tersedia versi lain
Informasi
Akses Katalog Publik Daring - Gunakan fasilitas pencarian untuk mempercepat penemuan data katalog